Круто. mySQL не поддерживает в полной мере спецификацию OpenGIS. А именно, функции отношений (Within, Contains и т.д.) работают только с прямоугольными геометриями.
Нужна другая СУБД.
Пробуем DB2. Два дня я убил на установку и настройку этого монстра. И тут выясняется, что 512 МБ оперативки - это слишком мало. Была без сожаления снесена.
Нас спасет PostgreSQL + PostGIS.